Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC46.45■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
SMARCA2P51531 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
SMARCA2P51531 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SMARCA2P51531 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
SMARCA2P51531 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
SMARCA2P51531 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
SMARCA2P51531 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
SMARCA2P51531 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
SMARCA2P51531 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
SMARCA2P51531 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
SMARCA2P51531 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SMARCA2P51531 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
SMARCA2P51531 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SMARCA2P51531 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
SMARCA2P51531 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
SMARCA2P51531 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
SMARCA2P51531 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
SMARCA2P51531 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
SMARCA2P51531 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
SMARCA2P51531 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC46.3■■■■■ 5
SMARCA2P51531 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
SMARCA2P51531 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
SMARCA2P51531 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC46.29■■■■■ 5
SMARCA2P51531 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
SMARCA2P51531 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC46.28■■■■■ 5
SMARCA2P51531 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA2P51531 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA2P51531 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA2P51531 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA2P51531 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA2P51531 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA2P51531 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC46.27■■■■■ 5
SMARCA2P51531 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
SMARCA2P51531 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
SMARCA2P51531 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
SMARCA2P51531 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
SMARCA2P51531 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC46.23■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC46.23■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
SMARCA2P51531 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
SMARCA2P51531 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
SMARCA2P51531 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
SMARCA2P51531 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
SMARCA2P51531 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
SMARCA2P51531 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
SMARCA2P51531 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
SMARCA2P51531 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
SMARCA2P51531 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC46.12■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC46.12■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC46.1■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.09■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC46.08■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
SMARCA2P51531 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC46.02■■■■■ 4.96
SMARCA2P51531 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms