Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PSEN1P49768 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSEN1P49768 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSEN1P49768 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSEN1P49768 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSEN1P49768 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms