Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD2P49005 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD2P49005 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD2P49005 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD2P49005 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD2P49005 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD2P49005 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD2P49005 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD2P49005 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD2P49005 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD2P49005 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD2P49005 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD2P49005 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD2P49005 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD2P49005 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD2P49005 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD2P49005 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD2P49005 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD2P49005 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD2P49005 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD2P49005 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD2P49005 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD2P49005 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD2P49005 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD2P49005 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD2P49005 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD2P49005 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD2P49005 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD2P49005 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD2P49005 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD2P49005 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD2P49005 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD2P49005 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD2P49005 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD2P49005 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD2P49005 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD2P49005 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD2P49005 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD2P49005 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD2P49005 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD2P49005 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD2P49005 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD2P49005 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD2P49005 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD2P49005 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD2P49005 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD2P49005 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD2P49005 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD2P49005 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD2P49005 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD2P49005 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD2P49005 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD2P49005 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD2P49005 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD2P49005 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD2P49005 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD2P49005 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD2P49005 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD2P49005 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD2P49005 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD2P49005 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD2P49005 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD2P49005 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD2P49005 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD2P49005 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD2P49005 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD2P49005 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD2P49005 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD2P49005 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD2P49005 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD2P49005 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD2P49005 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD2P49005 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD2P49005 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD2P49005 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD2P49005 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD2P49005 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD2P49005 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD2P49005 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms