Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 INH1YDL181W 258 nt9.81□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 YJR142WYJR142W 1029 nt9.81□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 YPL067CYPL067C 597 nt9.81□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 NMA2YGR010W 1188 nt9.8□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 EHT1YBR177C 1356 nt9.8□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 YPL136WYPL136W 369 nt9.8□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 QRI5YLR204W 336 nt9.79□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 MSI1YBR195C 1269 nt9.79□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 HEL2YDR266C 1920 nt9.78□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 SPS1YDR523C 1473 nt9.78□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 PSA1YDL055C 1086 nt9.77□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 TRP2YER090W 1524 nt9.76□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 INO1YJL153C 1602 nt9.76□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 OPI7YDR360W 435 nt9.76□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 TES1YJR019C 1050 nt9.76□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 ERV2YPR037C 591 nt9.76□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 MDH1YKL085W 1005 nt9.75□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 THI6YPL214C 1623 nt9.75□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 YDR387CYDR387C 1668 nt9.75□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 DCR2YLR361C 1737 nt9.74□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 OSM1YJR051W 1506 nt9.74□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 STS1YIR011C 960 nt9.72□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 HIS3YOR202W 663 nt9.72□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 LIA1YJR070C 978 nt9.71□□□□□ -0.85
YRF1-2P40105 NAF1YNL124W 1479 nt9.71□□□□□ -0.86
YRF1-2P40105 MRPL35YDR322W 1104 nt9.7□□□□□ -0.86
YRF1-2P40105 SCS22YBL091C-A 528 nt9.7□□□□□ -0.86
YRF1-2P40105 OPI1YHL020C 1215 nt9.68□□□□□ -0.86
YRF1-2P40105 YML122CYML122C 381 nt9.68□□□□□ -0.86
YRF1-2P40105 snR30snR30 606 nt9.67□□□□□ -0.86
YRF1-2P40105 CYT1YOR065W 930 nt9.66□□□□□ -0.86
YRF1-2P40105 ABP1YCR088W 1779 nt9.66□□□□□ -0.86
YRF1-2P40105 SNP1YIL061C 903 nt9.64□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 ERV25YML012W 636 nt9.64□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 MRPL19YNL185C 477 nt9.64□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 SRM1YGL097W 1449 nt9.64□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 NDE2YDL085W 1638 nt9.64□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 FET5YFL041W 1869 nt9.64□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 HAM1YJR069C 594 nt9.63□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 YNL295WYNL295W 1575 nt9.63□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 HXT11YOL156W 1704 nt9.62□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 DSC3YOR223W 879 nt9.61□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 MTC6YHR151C 1581 nt9.61□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 GPD1YDL022W 1176 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 YKL147CYKL147C 618 nt9.6□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 WSC4YHL028W 1818 nt9.59□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 INP54YOL065C 1155 nt9.59□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 WSC3YOL105C 1671 nt9.59□□□□□ -0.87
YRF1-2P40105 STE3YKL178C 1413 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 YJL225CYJL225C 5277 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 SKP1YDR328C 585 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 DRE2YKR071C 1047 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 YLR162WYLR162W 357 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 DPM1YPR183W 804 nt9.58□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 SSC1YJR045C 1965 nt9.57□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 TDA4YJR116W 840 nt9.57□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 DML1YMR211W 1428 nt9.56□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 RRP43YCR035C 1185 nt9.56□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 IRC7YFR055W 1023 nt9.56□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 IMG1YCR046C 510 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 GLY1YEL046C 1164 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 DST1YGL043W 930 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 TIF3YPR163C 1311 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 YLR072WYLR072W 2082 nt9.55□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 INM1YHR046C 888 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 ELP6YMR312W 822 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 AOS1YPR180W 1044 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 MAE1YKL029C 2010 nt9.54□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 PPZ2YDR436W 2133 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 YGR137WYGR137W 375 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 YOR200WYOR200W 399 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 LEA1YPL213W 717 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 YPC1YBR183W 951 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 MRN1YPL184C 1839 nt9.53□□□□□ -0.88
YRF1-2P40105 PIL1YGR086C 1020 nt9.52□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 MNN9YPL050C 1188 nt9.52□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 TGL5YOR081C 2250 nt9.52□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 MRP7YNL005C 1116 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 FSF1YOR271C 984 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 PAB1YER165W 1734 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 SML1YML058W 315 nt9.51□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 PRY2YKR013W 990 nt9.5□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 CPR2YHR057C 618 nt9.49□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 YKL153WYKL153W 510 nt9.49□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 FCY22YER060W-A 1593 nt9.49□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 VPS65YLR322W 315 nt9.48□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 YPR130CYPR130C 408 nt9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 HRB1YNL004W 1365 nt9.47□□□□□ -0.89
YRF1-2P40105 TPO4YOR273C 1980 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 TPO1YLL028W 1761 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 FYV1YDR024W 486 nt9.45□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 FIT1YDR534C 1587 nt9.44□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 MIM1YOL026C 342 nt9.43□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms