Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
PTPRGP23470 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC41■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PTPRGP23470 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRGP23470 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
PTPRGP23470 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PTPRGP23470 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PTPRGP23470 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PTPRGP23470 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PTPRGP23470 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PTPRGP23470 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PTPRGP23470 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms