Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTMSP20962 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTMSP20962 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTMSP20962 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTMSP20962 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTMSP20962 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTMSP20962 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTMSP20962 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTMSP20962 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTMSP20962 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTMSP20962 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTMSP20962 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTMSP20962 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTMSP20962 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTMSP20962 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTMSP20962 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTMSP20962 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTMSP20962 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTMSP20962 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTMSP20962 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTMSP20962 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTMSP20962 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTMSP20962 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTMSP20962 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTMSP20962 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTMSP20962 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTMSP20962 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTMSP20962 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTMSP20962 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTMSP20962 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTMSP20962 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTMSP20962 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTMSP20962 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTMSP20962 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTMSP20962 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTMSP20962 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTMSP20962 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTMSP20962 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTMSP20962 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTMSP20962 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTMSP20962 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTMSP20962 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTMSP20962 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTMSP20962 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTMSP20962 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTMSP20962 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTMSP20962 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTMSP20962 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTMSP20962 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTMSP20962 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTMSP20962 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTMSP20962 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTMSP20962 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTMSP20962 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTMSP20962 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTMSP20962 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTMSP20962 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTMSP20962 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTMSP20962 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMSP20962 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMSP20962 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMSP20962 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMSP20962 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMSP20962 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTMSP20962 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTMSP20962 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTMSP20962 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTMSP20962 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTMSP20962 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTMSP20962 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTMSP20962 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTMSP20962 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTMSP20962 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTMSP20962 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTMSP20962 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTMSP20962 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTMSP20962 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTMSP20962 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTMSP20962 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTMSP20962 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTMSP20962 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTMSP20962 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTMSP20962 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTMSP20962 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTMSP20962 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTMSP20962 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTMSP20962 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTMSP20962 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PTMSP20962 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTMSP20962 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTMSP20962 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMSP20962 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMSP20962 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMSP20962 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMSP20962 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMSP20962 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMSP20962 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMSP20962 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTMSP20962 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTMSP20962 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms