Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUC1P15941 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUC1P15941 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUC1P15941 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUC1P15941 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUC1P15941 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUC1P15941 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MUC1P15941 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUC1P15941 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUC1P15941 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MUC1P15941 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MUC1P15941 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUC1P15941 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MUC1P15941 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUC1P15941 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUC1P15941 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUC1P15941 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUC1P15941 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MUC1P15941 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MUC1P15941 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MUC1P15941 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUC1P15941 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUC1P15941 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUC1P15941 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUC1P15941 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MUC1P15941 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MUC1P15941 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MUC1P15941 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MUC1P15941 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MUC1P15941 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MUC1P15941 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MUC1P15941 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MUC1P15941 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MUC1P15941 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MUC1P15941 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC1P15941 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC1P15941 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC1P15941 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MUC1P15941 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC1P15941 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC1P15941 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC1P15941 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MUC1P15941 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC1P15941 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC1P15941 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC1P15941 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MUC1P15941 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC1P15941 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC1P15941 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC1P15941 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC1P15941 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC1P15941 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC1P15941 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC1P15941 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MUC1P15941 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC1P15941 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC1P15941 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MUC1P15941 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC1P15941 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC1P15941 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC1P15941 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC1P15941 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC1P15941 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC1P15941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MUC1P15941 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC1P15941 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC1P15941 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MUC1P15941 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC1P15941 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC1P15941 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC1P15941 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MUC1P15941 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms