Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFITM1P13164 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFITM1P13164 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM1P13164 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM1P13164 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms