Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKBP12277 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKBP12277 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKBP12277 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CKBP12277 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CKBP12277 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CKBP12277 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CKBP12277 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CKBP12277 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CKBP12277 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CKBP12277 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CKBP12277 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CKBP12277 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CKBP12277 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKBP12277 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKBP12277 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKBP12277 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CKBP12277 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKBP12277 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKBP12277 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKBP12277 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CKBP12277 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKBP12277 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKBP12277 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKBP12277 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKBP12277 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKBP12277 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKBP12277 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKBP12277 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKBP12277 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKBP12277 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKBP12277 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKBP12277 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKBP12277 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKBP12277 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKBP12277 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKBP12277 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKBP12277 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKBP12277 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKBP12277 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CKBP12277 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKBP12277 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKBP12277 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKBP12277 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKBP12277 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CKBP12277 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CKBP12277 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CKBP12277 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CKBP12277 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CKBP12277 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CKBP12277 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CKBP12277 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CKBP12277 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CKBP12277 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKBP12277 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKBP12277 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKBP12277 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKBP12277 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKBP12277 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKBP12277 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CKBP12277 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKBP12277 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKBP12277 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKBP12277 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CKBP12277 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CKBP12277 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CKBP12277 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CKBP12277 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CKBP12277 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CKBP12277 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CKBP12277 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CKBP12277 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CKBP12277 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKBP12277 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKBP12277 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CKBP12277 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKBP12277 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CKBP12277 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKBP12277 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKBP12277 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKBP12277 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKBP12277 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKBP12277 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKBP12277 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKBP12277 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CKBP12277 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKBP12277 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKBP12277 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CKBP12277 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CKBP12277 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CKBP12277 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CKBP12277 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKBP12277 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKBP12277 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKBP12277 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKBP12277 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKBP12277 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CKBP12277 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CKBP12277 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CKBP12277 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms