Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TBX18O95935 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TBX18O95935 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TBX18O95935 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TBX18O95935 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TBX18O95935 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TBX18O95935 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TBX18O95935 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TBX18O95935 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TBX18O95935 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TBX18O95935 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TBX18O95935 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TBX18O95935 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TBX18O95935 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TBX18O95935 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TBX18O95935 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TBX18O95935 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBX18O95935 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBX18O95935 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TBX18O95935 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBX18O95935 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TBX18O95935 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TBX18O95935 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TBX18O95935 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TBX18O95935 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBX18O95935 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBX18O95935 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBX18O95935 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBX18O95935 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBX18O95935 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBX18O95935 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBX18O95935 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TBX18O95935 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBX18O95935 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBX18O95935 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBX18O95935 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBX18O95935 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBX18O95935 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TBX18O95935 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBX18O95935 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBX18O95935 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBX18O95935 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TBX18O95935 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBX18O95935 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBX18O95935 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBX18O95935 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TBX18O95935 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TBX18O95935 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX18O95935 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX18O95935 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX18O95935 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX18O95935 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX18O95935 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX18O95935 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX18O95935 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX18O95935 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TBX18O95935 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBX18O95935 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBX18O95935 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TBX18O95935 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TBX18O95935 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TBX18O95935 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TBX18O95935 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TBX18O95935 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TBX18O95935 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TBX18O95935 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TBX18O95935 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TBX18O95935 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TBX18O95935 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TBX18O95935 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TBX18O95935 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TBX18O95935 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TBX18O95935 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TBX18O95935 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TBX18O95935 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TBX18O95935 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TBX18O95935 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TBX18O95935 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TBX18O95935 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TBX18O95935 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TBX18O95935 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TBX18O95935 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TBX18O95935 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TBX18O95935 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TBX18O95935 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TBX18O95935 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TBX18O95935 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TBX18O95935 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TBX18O95935 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TBX18O95935 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms