Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SVILO95425 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SVILO95425 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SVILO95425 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SVILO95425 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SVILO95425 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SVILO95425 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SVILO95425 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SVILO95425 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SVILO95425 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SVILO95425 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SVILO95425 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SVILO95425 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SVILO95425 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SVILO95425 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SVILO95425 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SVILO95425 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SVILO95425 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SVILO95425 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SVILO95425 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SVILO95425 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVILO95425 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVILO95425 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SVILO95425 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SVILO95425 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SVILO95425 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SVILO95425 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SVILO95425 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SVILO95425 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SVILO95425 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SVILO95425 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SVILO95425 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SVILO95425 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SVILO95425 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SVILO95425 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SVILO95425 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SVILO95425 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SVILO95425 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SVILO95425 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVILO95425 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVILO95425 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVILO95425 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVILO95425 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVILO95425 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SVILO95425 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVILO95425 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SVILO95425 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVILO95425 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVILO95425 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SVILO95425 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SVILO95425 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SVILO95425 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SVILO95425 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SVILO95425 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVILO95425 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVILO95425 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVILO95425 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SVILO95425 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVILO95425 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVILO95425 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SVILO95425 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVILO95425 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVILO95425 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVILO95425 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVILO95425 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVILO95425 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVILO95425 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVILO95425 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SVILO95425 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SVILO95425 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SVILO95425 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SVILO95425 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVILO95425 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVILO95425 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVILO95425 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SVILO95425 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVILO95425 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVILO95425 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVILO95425 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVILO95425 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVILO95425 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVILO95425 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SVILO95425 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVILO95425 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SVILO95425 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SVILO95425 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SVILO95425 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SVILO95425 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SVILO95425 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVILO95425 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVILO95425 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SVILO95425 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVILO95425 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVILO95425 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SVILO95425 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVILO95425 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVILO95425 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVILO95425 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SVILO95425 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SVILO95425 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms