Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN9O75954 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN9O75954 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN9O75954 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN9O75954 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN9O75954 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN9O75954 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN9O75954 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN9O75954 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN9O75954 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN9O75954 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN9O75954 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN9O75954 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN9O75954 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN9O75954 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN9O75954 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN9O75954 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN9O75954 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN9O75954 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN9O75954 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN9O75954 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN9O75954 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN9O75954 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN9O75954 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN9O75954 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN9O75954 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN9O75954 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN9O75954 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN9O75954 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN9O75954 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN9O75954 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSPAN9O75954 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms