Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM38O00635 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM38O00635 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM38O00635 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM38O00635 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM38O00635 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms