Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
O00370 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
O00370 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
O00370 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
O00370 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
O00370 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
O00370 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
O00370 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
O00370 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
O00370 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
O00370 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
O00370 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
O00370 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
O00370 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
O00370 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
O00370 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
O00370 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
O00370 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
O00370 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
O00370 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
O00370 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
O00370 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
O00370 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
O00370 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
O00370 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
O00370 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
O00370 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
O00370 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
O00370 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
O00370 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
O00370 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
O00370 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
O00370 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
O00370 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
O00370 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
O00370 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
O00370 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
O00370 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
O00370 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
O00370 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
O00370 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27■■□□□ 1.91
O00370 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
O00370 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
O00370 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
O00370 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
O00370 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
O00370 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
O00370 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
O00370 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
O00370 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
O00370 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
O00370 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
O00370 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
O00370 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
O00370 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
O00370 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
O00370 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
O00370 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
O00370 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
O00370 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
O00370 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
O00370 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
O00370 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
O00370 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
O00370 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
O00370 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
O00370 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
O00370 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
O00370 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
O00370 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
O00370 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
O00370 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
O00370 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
O00370 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
O00370 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
O00370 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
O00370 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
O00370 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
O00370 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
O00370 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
O00370 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
O00370 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
O00370 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
O00370 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
O00370 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
O00370 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
O00370 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
O00370 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
O00370 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
O00370 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms