Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srsf11E9Q6E5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srsf11E9Q6E5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srsf11E9Q6E5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Srsf11E9Q6E5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srsf11E9Q6E5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms