RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000205287.1

Tsen34-211, Transcript of tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Tsen34, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa53,99■■■■■ 6,23
Tsen34-211ENSMUST00000205287 NischQ80TM9 1593 aa53,35■■■■■ 6,13
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Tsen34-211ENSMUST00000205287 Abcc9P70170 1546 aa51,62■■■■■ 5,85
Tsen34-211ENSMUST00000205287 ScribQ80U72 1612 aa49,73■■■■■ 5,55
Tsen34-211ENSMUST00000205287 NacadQ5SWP3 1504 aa48,27■■■■■ 5,32
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Kdm5dQ62240 1548 aa48,13■■■■■ 5,3
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Dcaf1Q80TR8 1506 aa47,54■■■■■ 5,2
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Sycp2Q9CUU3 1500 aa47,33■■■■■ 5,17
Tsen34-211ENSMUST00000205287 BicraF8VPZ9 1578 aa46,62■■■■■ 5,05
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46,44■■■■■ 5,03
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Rhox8Q6VSS7 320 aa46,07■■■■■ 4,97
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Baz1aO88379 1555 aa45,83■■■■■ 4,93
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Crybg2B7ZCC2 1516 aa45,78■■■■■ 4,92
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Ccdc180J3QNE4 1664 aa45,7■■■■■ 4,91
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa45,52■■■■■ 4,88
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP45,43■■■■■ 4,86
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45,19■■■■■ 4,82
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP44,98■■■■■ 4,79
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP44,96■■■■■ 4,79
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP44,5■■■■■ 4,71
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Smarca2Q6DIC0 1577 aa44,48■■■■■ 4,71
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa44,42■■■■■ 4,7
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Ercc6F8VPZ5 1481 aa44,41■■■■■ 4,7
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa44,26■■■■■ 4,68
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa44,21■■■■■ 4,67
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Fam135aQ6NS59 1506 aa43,97■■■■■ 4,63
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Wdr62Q3U3T8 1523 aa43,93■■■■■ 4,62
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Frmpd1A2AKB4 1549 aa43,9■■■■■ 4,62
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP43,74■■■■■ 4,59
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Baz1bQ9Z277 1479 aa43,57■■■■■ 4,57
Tsen34-211ENSMUST00000205287 CftrP26361 1476 aa43,44■■■■■ 4,54
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Rtl1Q7M732 1744 aa43,41■■■■■ 4,54
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Ubl4bQ9CQ84 188 aa43,32■■■■■ 4,53
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43,31■■■■■ 4,52
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43,24■■■■■ 4,51
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Synj1Q8CHC4 1574 aa43,23■■■■■ 4,51
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43,15■■■■■ 4,5
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Unc13aQ4KUS2 1712 aa43,02■■■■■ 4,48
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Mrc2Q64449 1479 aa42,97■■■■■ 4,47
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP42,65■■■■■ 4,42
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Trim41Q5NCC3 630 aa42,55■■■■■ 4,4
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP42,42■■■■■ 4,38
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Kif15Q6P9L6 1387 aa42,34■■■■■ 4,37
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Cux2P70298 1426 aa42,33■■■■■ 4,37
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42,11■■■■■ 4,33
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP41,9■■■■■ 4,3
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa41,9■■■■■ 4,3
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Kif21aQ9QXL2 1672 aa41,83■■■■■ 4,29
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Golga3P55937 1487 aa41,74■■■■■ 4,27
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Cep164Q5DU05 1446 aa41,74■■■■■ 4,27
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Top2bQ64511 1612 aa41,59■■■■■ 4,25
Tsen34-211ENSMUST00000205287 TnnQ80Z71 1560 aa41,59■■■■■ 4,25
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Ccdc18Q640L5 1455 aa41,54■■■■■ 4,24
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Cngb1E1AZ71 1325 aa41,53■■■■■ 4,24
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP41,44■■■■■ 4,23
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Il27Q8K3I6 234 aa41,42■■■■■ 4,22
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Tsen34-211ENSMUST00000205287 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP41,35■■■■■ 4,21
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Camsap1A2AHC3 1581 aa41,32■■■■■ 4,21
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP41,32■■■■■ 4,21
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Plb1Q3TTY0 1478 aa41,3■■■■■ 4,2
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Fmn1Q05860 1466 aa41,28■■■■■ 4,2
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Dnajc5P60904 198 aa41,27■■■■■ 4,2
Tsen34-211ENSMUST00000205287 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41,12■■■■■ 4,17
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Crocc2F6XLV1 1638 aa41,11■■■■■ 4,17
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Shroom2A2ALU4 1481 aa40,99■■■■■ 4,15
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Ift140E9PY46 1464 aa40,94■■■■■ 4,14
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Duox2A2AQ99 1517 aa40,9■■■■■ 4,14
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Grin2bQ01097 1482 aa40,83■■■■■ 4,13
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Rusc2Q80U22 1514 aa40,73■■■■■ 4,11
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Disp1Q3TDN0 1521 aa40,65■■■■■ 4,1
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Efcab5A0JP43 1406 aa40,64■■■■■ 4,1
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP40,6■■■■■ 4,09
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa40,58■■■■■ 4,09
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Samd9lQ69Z37 1561 aa40,49■■■■■ 4,07
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP40,48■■■■■ 4,07
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa40,44■■■■■ 4,06
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP40,43■■■■■ 4,06
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Col17a1Q07563 1470 aa40,41■■■■■ 4,06
Tsen34-211ENSMUST00000205287 NrkQ9R0G8 1455 aa40,39■■■■■ 4,06
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP40,33■■■■■ 4,05
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Chic1Q8CBW7 227 aa40,32■■■■■ 4,04
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP40,28■■■■■ 4,04
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40,28■■■■■ 4,04
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Grin2aP35436 1464 aa40,19■■■■■ 4,02
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40,17■■■■■ 4,02
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Shroom4Q1W617 1475 aa40,16■■■■■ 4,02
Tsen34-211ENSMUST00000205287 PtprkP35822 1457 aa40,13■■■■■ 4,02
Tsen34-211ENSMUST00000205287 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40,11■■■■■ 4,01
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Setd1bQ8CFT2 1985 aa40,08■■■■■ 4,01
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40,02■■■■■ 4
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP39,99■■■■□ 3,99
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Pla2r1Q62028 1487 aa39,93■■■■□ 3,98
Tsen34-211ENSMUST00000205287 SynmQ70IV5 1561 aa39,93■■■■□ 3,98
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Gpatch8A2A6A1 1505 aa39,91■■■■□ 3,98
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Zeb1Q64318 1117 aa39,79■■■■□ 3,96
Tsen34-211ENSMUST00000205287 AknaQ80VW7 1404 aa39,65■■■■□ 3,94
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa39,64■■■■□ 3,94
Tsen34-211ENSMUST00000205287 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa39,63■■■■□ 3,93
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