Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf172C9J069 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf172C9J069 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C9orf172C9J069 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C9orf172C9J069 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms