Protein–RNA interactions for Protein: A6NNH2

FAM90A27P, Protein FAM90A27P, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A27PA6NNH2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM90A27PA6NNH2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM90A27PA6NNH2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM90A27PA6NNH2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM90A27PA6NNH2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM90A27PA6NNH2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM90A27PA6NNH2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM90A27PA6NNH2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM90A27PA6NNH2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms