Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC10BA6NIK2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC10BA6NIK2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC10BA6NIK2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC10BA6NIK2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC10BA6NIK2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC10BA6NIK2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms