Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPOPA6NHQ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EPOPA6NHQ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPOPA6NHQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPOPA6NHQ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms