Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms