Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
GRIK4Q16099 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms