Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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