Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SCARF1Q14162 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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