Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
GRIN2BQ13224 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms