Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PRPF4BQ13523 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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