Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms