Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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CCDC6Q16204 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CCDC6Q16204 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CCDC6Q16204 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CCDC6Q16204 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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