Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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PGPEP1Q9NXJ5 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PGPEP1Q9NXJ5 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGPEP1Q9NXJ5 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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