Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms