Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRG3-202ENST00000370354 650 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR629-201ENST00000385230 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR503-201ENST00000385270 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR874-201ENST00000401190 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 POTEF-202ENST00000409914 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CHCHD2P4-201ENST00000418701 434 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC145543.1-201ENST00000424770 586 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL18P-201ENST00000466851 291 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL110P-201ENST00000498222 283 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC112173.1-201ENST00000505876 327 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL10P9-201ENST00000522551 645 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LYNX1-207ENST00000523332 600 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R1AP1-201ENST00000525622 425 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KHNYN-203ENST00000554268 760 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CD160-204ENST00000584442 219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006504.5-205ENST00000588318 432 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF5CP-201ENST00000591298 325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GLOD4-218ENST00000625892 111 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GLOD4-219ENST00000628529 111 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP9-1-202ENST00000634235 351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AKT3-203ENST00000366539 5127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP2K4-202ENST00000415385 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB24-201ENST00000230122 5519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM1-204ENST00000614490 4196 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DNHD1-202ENST00000354685 3205 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMG3-AS1-203ENST00000457484 3839 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MBTPS2-202ENST00000379484 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B3-205ENST00000393842 4064 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAD10-203ENST00000455480 4071 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TCERG1-201ENST00000296702 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC8-202ENST00000389817 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000552.1-202ENST00000436681 3714 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC12-201ENST00000314756 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC31-202ENST00000410003 3358 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF14-205ENST00000394520 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN5A-206ENST00000425664 8450 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP4-220ENST00000622174 2651 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF4-201ENST00000326016 3666 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF2-201ENST00000378164 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01001-201ENST00000526704 2553 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms