Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C3Q9Y5Q9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms