Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLDN16Q9Y5I7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms