Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q9Y3F1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms