Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRAP3Q9Y2W1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms