Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms