Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LHX6Q9UPM6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LHX6Q9UPM6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms