Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
L1RE1Q9UN81 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
L1RE1Q9UN81 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
L1RE1Q9UN81 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
L1RE1Q9UN81 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
L1RE1Q9UN81 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
L1RE1Q9UN81 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms