Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CIZ1Q9ULV3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CIZ1Q9ULV3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms