Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJD2Q9UKL4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJD2Q9UKL4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms