Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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