Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EPHA6Q9UF33 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms