Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLKQ9UBT6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLKQ9UBT6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms