Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRPC4Q9UBN4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC4Q9UBN4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms