Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms