Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC88CQ9P219 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms