Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCMF1Q9P0J7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCMF1Q9P0J7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms