Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMOD2Q9NZR1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMOD2Q9NZR1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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