Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NKIRAS2Q9NYR9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms