Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VNN3Q9NY84 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VNN3Q9NY84 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms